Основными задачами Министерства являются:
- обеспечение и защита конституционного права граждан Республики Южная Осетия на образование;
- создание правовых, экономических и финансовых условий для свободного функционирования и развития системы образования Республики Южная Осетия;
- создание правовых гарантий для согласования интересов участников отношений в сфере образования;
- определение правового положения участников отношений в сфере образования;
- создание условий для получения образования в Республике Южная Осетия иностранными гражданами и лицами без гражданства;
- разграничение полномочий в сфере образования между органом государственной власти Республики Южная Осетия, уполномоченным в сфере образования и местными органами государственной власти Республики Южная Осетия.